南湖山椒魚吻肛長大約8公分，全長大約14公分。成體背部以深褐色為主，其上綴有黃褐色或金黃色之不規則花紋；和台灣山椒魚相比，花紋通常較密、範圍較大。前肢具4趾，後肢通常為5趾。目前為止發現地點以及數量都相當稀少，環境則相對於其他四種山椒魚，明顯開闊許多。可能是調查難度過高，因此尚未找到族群熱點。推測應是利用高山融化之雪水進行繁殖。

目前發現地區集中在南湖大山周圍，海拔約3000至3500 公尺處。

目前發現南湖山椒魚的棲息地皆以開闊環境之石頭下為主。